要解决AWS Lambda无法读取Athena数据库文件并将其写入S3的问题，您可以使用AWS SDK for Python（boto3）来实现。下面是一个示例代码，演示了如何使用boto3在Lambda函数中读取Athena数据库文件并将其写入S3存储桶。

import boto3

def lambda_handler(event, context):
    # 初始化boto3客户端
    athena_client = boto3.client('athena')
    s3_client = boto3.client('s3')
    
    # 执行Athena查询
    response = athena_client.start_query_execution(
        QueryString='SELECT * FROM your_table',
        QueryExecutionContext={
            'Database': 'your_database'
        },
        ResultConfiguration={
            'OutputLocation': 's3://your_bucket/athena_output/'
        }
    )
    
    # 获取查询结果文件路径
    execution_id = response['QueryExecutionId']
    result_path = f"s3://your_bucket/athena_output/{execution_id}.csv"
    
    # 等待查询结果
    waiter = athena_client.get_waiter('query_execution_complete')
    waiter.wait(QueryExecutionId=execution_id)
    
    # 从S3下载查询结果文件到Lambda的临时目录
    result_file = f"/tmp/{execution_id}.csv"
    s3_client.download_file('your_bucket', f'athena_output/{execution_id}.csv', result_file)
    
    # 将查询结果文件上传到目标S3存储桶
    s3_client.upload_file(result_file, 'destination_bucket', 'result.csv')
    
    return {
        'statusCode': 200,
        'body': 'Query result saved to S3'
    }

请注意，上述代码假设您已经正确配置了Athena和S3，并具有合适的访问权限。您需要替换代码中的占位符（例如your_table，your_database，your_bucket等）以匹配您自己的配置。

此代码将执行Athena查询并等待查询完成。然后，它将从Athena查询结果的S3位置下载文件，并将其上传到目标S3存储桶中。您可以根据自己的需求进行修改和调整。