可以使用以下 Python 代码，使用 aws-encryption-cli 加密文件时避免加入换行符：

import subprocess

def encrypt_with_aws_encryption_cli(src_file, dst_file, key_id, region):
    command = [
        "aws", "encryption", "cli",
        "encrypt",
        "--input", src_file,
        "--output", dst_file,
        "--encryption-context", f"key_id={key_id}",
        "--region", region,
        "--metadata-output", "-"
    ]
    result = subprocess.run(command, capture_output=True)
    if result.returncode != 0:
        raise RuntimeError(result.stderr.decode("utf-8"))
    
    metadata = result.stdout.decode("utf-8").strip().split("\n")
    metadata = "\n".join([line for line in metadata if not line.startswith("x-amz-iv")])
    return metadata

该函数从 Python 调用 aws-encryption-cli 工具来进行文件加密。在调用中添加 --metadata-output 参数将元数据输出到标准输出。这个元数据包含有用的信息，例如加密所用的算法和密钥 ID。在元数据中，有一行以 x-amz-iv 开头的行包含随机初始化向量（IV），而其他行包含加密上下文。我们使用 Python 函数的 split() 方法从字符串中分离行，并只保留不包含 x-amz-iv 的行。最后，我们使用 join() 方法将这些行组合在一起，以便作为函数的返回值返回。