要保护SQLite格式3仅供特定应用程序使用，可以使用以下代码示例中的方法：

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.nio.channels.FileChannel;

public class SQLiteProtection {

    public static void main(String[] args) {
        protectSQLiteDatabase("path/to/original/database.db", "path/to/protected/database.db");
    }

    private static void protectSQLiteDatabase(String originalPath, String protectedPath) {
        try {
            // Open the original SQLite database file
            File originalFile = new File(originalPath);
            FileInputStream originalStream = new FileInputStream(originalFile);
            FileChannel originalChannel = originalStream.getChannel();

            // Create a new file for the protected SQLite database
            File protectedFile = new File(protectedPath);
            protectedFile.createNewFile();
            FileOutputStream protectedStream = new FileOutputStream(protectedFile);
            FileChannel protectedChannel = protectedStream.getChannel();

            // Transfer the contents from original to protected file
            protectedChannel.transferFrom(originalChannel, 0, originalChannel.size());

            // Close the file channels and streams
            originalChannel.close();
            originalStream.close();
            protectedChannel.close();
            protectedStream.close();

            System.out.println("SQLite database has been protected successfully!");
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

在上面的代码示例中，protectSQLiteDatabase方法接收原始SQLite数据库文件的路径和受保护SQLite数据库文件的路径作为参数。它使用Java的FileInputStream和FileOutputStream来打开和创建文件通道，并使用transferFrom方法将原始数据库的内容复制到受保护的数据库文件中。最后，关闭文件通道和流。

要使用此代码示例，您需要将"path/to/original/database.db"和"path/to/protected/database.db"替换为实际的原始和受保护的数据库文件路径。