并行I/O:文件每进程对比使用HDF5等库
创始人
2024-12-18 18:30:25
0

在并行计算中,对于需要进行大量I/O操作的程序,通常会使用文件I/O来读写数据。而在文件I/O的实现方式上,有两种常见的方式:一种是每个进程都打开一个独立的文件进行读写(即“文件每进程”方式),另一种是使用I/O库,如HDF5、MPI-IO等,来进行共享式I/O操作。下面是两种方式的代码说明:

文件每进程方式:

import mpi4py.MPI as MPI
import numpy as np
import os

comm = MPI.COMM_WORLD
rank = comm.rank

# 文件名
filename = "file_" + str(rank) + ".txt"
if os.path.exists(filename):
    os.remove(filename)

# 定义数据
data = np.ones(10) * rank

# 每个进程打开一个文件进行写操作
with open(filename, "w") as f:
    f.write(str(data))

I/O库方式(以HDF5为例):

import mpi4py.MPI as MPI
import numpy as np
import h5py

comm = MPI.COMM_WORLD
rank = comm.rank

# 文件名
filename = "data.h5"

# 创建数据集
f = h5py.File(filename, "a", driver="mpio", comm=comm)
dset = f.create_dataset("dataset", (10,), dtype='i')

# 每个进程对应的写入位置
start = rank * 10
end = (rank+1) * 10

# 向数据集写入数据
dset[start:end] = np.ones(10) * rank

# 关闭文件
f.close()

从以上两种方式的比较中可以看出,使用I/O库进行共享式I/O操作可以大大提高I/O性能,减少文件打开和关闭次数,避免了同时写入文件时的数据竞争问题,更加适合并行计算中

相关内容

热门资讯

【NI Multisim 14...   目录 序言 一、工具栏 🍊1.“标准”工具栏 🍊 2.视图工具...
银河麒麟V10SP1高级服务器... 银河麒麟高级服务器操作系统简介: 银河麒麟高级服务器操作系统V10是针对企业级关键业务...
不能访问光猫的的管理页面 光猫是现代家庭宽带网络的重要组成部分,它可以提供高速稳定的网络连接。但是,有时候我们会遇到不能访问光...
AWSECS:访问外部网络时出... 如果您在AWS ECS中部署了应用程序,并且该应用程序需要访问外部网络,但是无法正常访问,可能是因为...
Android|无法访问或保存... 这个问题可能是由于权限设置不正确导致的。您需要在应用程序清单文件中添加以下代码来请求适当的权限:此外...
北信源内网安全管理卸载 北信源内网安全管理是一款网络安全管理软件,主要用于保护内网安全。在日常使用过程中,卸载该软件是一种常...
AWSElasticBeans... 在Dockerfile中手动配置nginx反向代理。例如,在Dockerfile中添加以下代码:FR...
AsusVivobook无法开... 首先,我们可以尝试重置BIOS(Basic Input/Output System)来解决这个问题。...
ASM贪吃蛇游戏-解决错误的问... 要解决ASM贪吃蛇游戏中的错误问题,你可以按照以下步骤进行:首先,确定错误的具体表现和问题所在。在贪...
月入8000+的steam搬砖... 大家好,我是阿阳 今天要给大家介绍的是 steam 游戏搬砖项目,目前...