可以使用原生的Node.js操作mongodb数据库的驱动程序来实现不使用mongoose/mongodb填充对象键的功能。以下是一个示例代码：

const MongoClient = require('mongodb').MongoClient;

async function populateObjectKeys() {
  const url = 'mongodb://localhost:27017';
  const dbName = 'mydatabase';

  const client = new MongoClient(url, { useUnifiedTopology: true });

  try {
    await client.connect();

    const db = client.db(dbName);
    const collection = db.collection('mycollection');

    // 查询数据
    const data = await collection.findOne({});

    // 转换数据
    const transformedData = {};
    for (const key in data) {
      if (Object.prototype.hasOwnProperty.call(data, key)) {
        transformedData[key] = data[key];
      }
    }

    console.log(transformedData);
  } catch (err) {
    console.error(err);
  } finally {
    client.close();
  }
}

populateObjectKeys();

上述代码中，我们使用了mongodb模块提供的MongoClient来连接并操作数据库。首先，我们通过await client.connect()连接到数据库。然后，我们通过db.collection('mycollection')获取到要操作的集合（mycollection）。接下来，我们使用findOne({})方法查询集合中的一条数据。然后，我们使用一个循环遍历数据对象的所有键，并将其赋值给一个新的对象transformedData中。最后，我们打印出transformedData。

请注意，上述代码中的连接URL和数据库名称需要根据实际情况进行修改。