在ASP.NET中，使用TransmitFile方法将文件发送到客户端，并使用Response.End方法结束响应时，可能会导致在文件内容中附加“Thread was aborted”消息。

这是由于Response.End方法会引发一个ThreadAbortException异常，以终止当前线程的执行。该异常会被ASP.NET捕获并重新引发，以确保响应被正确结束。然而，这个异常会被写入到响应流中，从而在文件内容中显示出来。

为了解决这个问题，可以使用Response.Flush方法在调用Response.End之前将所有缓冲的数据发送到客户端。这样可以确保文件内容被完整发送，并且不会附加任何异常消息。

以下是一个示例代码：

string filePath = "path_to_your_file";
string fileName = "your_file_name";

Response.Clear();
Response.ContentType = "application/octet-stream";
Response.AddHeader("Content-Disposition", "attachment; filename=" + fileName);
Response.TransmitFile(filePath);

// Flush the response buffer before ending the response
Response.Flush();

try
{
    Response.End();
}
catch (ThreadAbortException)
{
    // Ignore the ThreadAbortException to prevent the exception message from being appended to the file content
}

在这个示例中，我们首先清除响应，设置正确的文件类型和文件名。然后使用TransmitFile方法将文件发送到客户端。在调用Response.End之前，使用Response.Flush方法将所有缓冲的数据发送到客户端。最后，我们使用一个try-catch块来捕获ThreadAbortException异常，并忽略它，以防止异常消息被附加到文件内容中。

通过这种方式，就可以解决使用TransmitFile和Response.End时附加“Thread was aborted”消息到文件内容中的问题。