AWS CodeBuild与Yarn Workspaces之间的兼容性问题可能是由于CodeBuild无法正确处理Yarn Workspaces中的依赖关系而引起的。为了解决这个问题，可以尝试以下解决方法：

1. 使用单独的Yarn Workspaces子项目构建：将Yarn Workspaces拆分为独立的子项目，并为每个子项目创建独立的CodeBuild构建规范。这样可以确保每个子项目的依赖关系被正确处理。

例如，假设Yarn Workspaces中有两个子项目：project-a和project-b。可以创建两个独立的CodeBuild规范分别构建这两个子项目：

version: 0.2

phases:
  install:
    runtime-versions:
      nodejs: 14
    commands:
      - cd project-a
      - yarn install
  build:
    commands:
      - cd project-a
      - yarn build

version: 0.2

phases:
  install:
    runtime-versions:
      nodejs: 14
    commands:
      - cd project-b
      - yarn install
  build:
    commands:
      - cd project-b
      - yarn build

2. 使用AWS CodePipeline：将Yarn Workspaces与AWS CodePipeline集成，以便能够按顺序构建和部署Yarn Workspaces中的子项目。可以使用CodePipeline的构建和部署阶段来确保正确处理依赖关系。

首先，在Yarn Workspaces的根目录中创建一个buildspec.yml文件，用于构建和测试所有子项目：

version: 0.2

phases:
  install:
    runtime-versions:
      nodejs: 14
    commands:
      - yarn install
  build:
    commands:
      - yarn build
  test:
    commands:
      - yarn test

然后，在AWS控制台中创建一个CodePipeline，并配置源和构建阶段。在构建阶段中，将buildspec.yml文件指定为构建规范，并确保正确设置构建环境和权限。

3. 使用其他构建工具：如果以上方法无法解决兼容性问题，可以考虑使用其他构建工具，如Jenkins或Travis CI，来代替AWS CodeBuild。这些构建工具通常具有更灵活的配置选项，可以更好地处理复杂的依赖关系。

以上是解决AWS CodeBuild与Yarn Workspaces不兼容的一些建议方法，具体选择方法取决于您的项目需求和团队偏好。