在AWS CodePipeline中，Dockerfile无法直接访问环境变量CODEBUILD_SRC_DIR和CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource。这是因为Dockerfile是在构建容器镜像的过程中执行的，而不是在CodePipeline中运行的。

要解决这个问题，你可以使用构建规范(buildspec)文件，将环境变量传递给Dockerfile。下面是一个示例：

1. 在CodePipeline的构建阶段中，添加一个构建规范文件buildspec.yaml，并将其与源代码一起存储在源代码存储库中。

2. 在buildspec.yaml文件中，添加一个环境变量节，将CODEBUILD_SRC_DIR和CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource传递给构建过程。示例如下：

version: 0.2

env:
  variables:
    CODEBUILD_SRC_DIR: $CODEBUILD_SRC_DIR
    CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource: $CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource

phases:
  build:
    commands:
      - docker build -t my_image --build-arg CODEBUILD_SRC_DIR=$CODEBUILD_SRC_DIR --build-arg CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource=$CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource .

3. 在Dockerfile中，添加参数ARG指令，以接收传递的环境变量。示例如下：

ARG CODEBUILD_SRC_DIR
ARG CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource

# 使用环境变量进行构建操作
COPY $CODEBUILD_SRC_DIR /app
COPY $CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource /secondary

上述示例中，通过构建规范文件将CODEBUILD_SRC_DIR和CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource传递给Dockerfile。在构建过程中，Dockerfile使用这些参数进行相应的操作。

这样，你就能够在AWS CodePipeline中的Dockerfile中访问环境变量CODEBUILD_SRC_DIR和CODEBUILD_SRC_DIR_SecondarySource了。