要在AWS HealthLake中执行FHIR链接查询，可以使用AWS SDK for Python（Boto3）来编写代码。以下是一个示例代码，演示如何在HealthLake中执行FHIR链接查询：

首先，确保您已安装了Boto3：

pip install boto3

然后，使用您的AWS凭证初始化Boto3客户端：

import boto3

# 初始化Boto3客户端
client = boto3.client('healthlake', region_name='YOUR_REGION', aws_access_key_id='YOUR_ACCESS_KEY', aws_secret_access_key='YOUR_SECRET_ACCESS_KEY')

接下来，使用start_fhir_export_job方法来启动一个FHIR导出作业。在此方法中，您需要提供HealthLake数据存储桶的位置、导出作业的名称和FHIR链接查询的详细信息。

# 启动FHIR导出作业
response = client.start_fhir_export_job(
    OutputDataConfig={
        'S3Uri': 's3://YOUR_OUTPUT_BUCKET' # 导出数据的目标存储桶位置
    },
    JobName='YOUR_EXPORT_JOB_NAME', # 导出作业的名称
    DataAccessRoleArn='YOUR_DATA_ACCESS_ROLE_ARN', # 数据访问角色的ARN
    InputDataConfig={
        'S3Uri': 's3://YOUR_INPUT_BUCKET' # HealthLake数据存储桶的位置
    },
    DataAccessRoleArn='YOUR_DATA_ACCESS_ROLE_ARN', # 数据访问角色的ARN
    DataFormat='COMPREHENDED', # 导出数据的格式
    ExportConfig={
        'DataTypes': [
            'CONDITION' # 要查询的FHIR链接的数据类型
        ],
        'S3UriPrefix': 's3://YOUR_EXPORT_BUCKET' # 匹配FHIR链接的目标存储桶位置
    }
)

# 获取导出作业的ARN
export_job_arn = response['JobId']

最后，您可以使用describe_fhir_export_job方法来获取导出作业的状态和进度。

# 获取导出作业的状态和进度
response = client.describe_fhir_export_job(JobId=export_job_arn)
status = response['ExportJobProperties']['DataAccessRoleArn']
progress = response['ExportJobProperties']['Progress']

这是一个简单的示例，演示了如何在AWS HealthLake中执行FHIR链接查询。您可以根据自己的需求进行修改和扩展。