在保护两个MVC应用之间的通信时，可以使用以下解决方法：

1. 使用身份验证和授权机制：在两个应用之间建立安全的通信通道，确保只有经过身份验证的用户才能访问另一个应用。可以使用Token、JWT或其他身份验证和授权机制来实现。

示例代码：

// 发送请求的应用
using System.Net.Http;
using System.Net.Http.Headers;

public async Task SendRequest(string url, string token)
{
    using (HttpClient client = new HttpClient())
    {
        client.DefaultRequestHeaders.Authorization = new AuthenticationHeaderValue("Bearer", token);
        HttpResponseMessage response = await client.GetAsync(url);
        response.EnsureSuccessStatusCode();
        return await response.Content.ReadAsStringAsync();
    }
}

// 接收请求的应用
[Authorize]
public class MyController : Controller
{
    public IActionResult Index()
    {
        return View();
    }
}

2. 使用加密和解密机制：在应用之间传输敏感数据时，可以使用加密和解密机制来确保数据安全。可以使用对称加密算法或非对称加密算法来加密和解密数据。

示例代码：

// 发送请求的应用
using System.Security.Cryptography;

public string EncryptData(string data, string publicKey)
{
    using (RSA rsa = RSA.Create())
    {
        rsa.ImportRSAPublicKey(Convert.FromBase64String(publicKey), out _);
        byte[] encryptedData = rsa.Encrypt(Encoding.UTF8.GetBytes(data), RSAEncryptionPadding.OaepSHA256);
        return Convert.ToBase64String(encryptedData);
    }
}

// 接收请求的应用
using System.Security.Cryptography;

public string DecryptData(string encryptedData, string privateKey)
{
    using (RSA rsa = RSA.Create())
    {
        rsa.ImportRSAPrivateKey(Convert.FromBase64String(privateKey), out _);
        byte[] decryptedData = rsa.Decrypt(Convert.FromBase64String(encryptedData), RSAEncryptionPadding.OaepSHA256);
        return Encoding.UTF8.GetString(decryptedData);
    }
}

3. 使用API密钥：为每个应用生成唯一的API密钥，用于在请求中进行身份验证。在接收请求的应用中，验证请求中的API密钥是否有效。

示例代码：

// 发送请求的应用
using System.Net.Http;
using System.Net.Http.Headers;

public async Task SendRequest(string url, string apiKey)
{
    using (HttpClient client = new HttpClient())
    {
        client.DefaultRequestHeaders.Add("X-API-Key", apiKey);
        HttpResponseMessage response = await client.GetAsync(url);
        response.EnsureSuccessStatusCode();
        return await response.Content.ReadAsStringAsync();
    }
}

// 接收请求的应用
public IActionResult Index(string apiKey)
{
    if (apiKey == "valid_api_key")
    {
        return View();
    }
    else
    {
        return Forbid();
    }
}

以上是几种保护两个MVC应用之间通信的解决方法的示例代码，具体应根据实际情况进行调整和扩展。