要解决Base64解码后输出结果不正确的问题，需要确保在解码过程中使用正确的字符编码。以下是使用Java语言的代码示例，其中包括使用UTF-8和UTF-16进行解码的解决方法：

import java.nio.charset.Charset;
import java.util.Base64;

public class Base64DecoderExample {
    public static void main(String[] args) {
        String encodedString = "SGVsbG8gV29ybGQh"; // Base64编码的字符串

        // 使用默认字符编码解码（通常为UTF-8）
        byte[] decodedBytes = Base64.getDecoder().decode(encodedString);
        String decodedString = new String(decodedBytes, Charset.defaultCharset());
        System.out.println("默认字符编码解码结果: " + decodedString);

        // 使用UTF-8字符编码解码
        byte[] decodedBytesUTF8 = Base64.getDecoder().decode(encodedString);
        String decodedStringUTF8 = new String(decodedBytesUTF8, Charset.forName("UTF-8"));
        System.out.println("UTF-8字符编码解码结果: " + decodedStringUTF8);

        // 使用UTF-16字符编码解码
        byte[] decodedBytesUTF16 = Base64.getDecoder().decode(encodedString);
        String decodedStringUTF16 = new String(decodedBytesUTF16, Charset.forName("UTF-16"));
        System.out.println("UTF-16字符编码解码结果: " + decodedStringUTF16);
    }
}

在上述代码中，我们使用Base64.getDecoder().decode()方法对Base64编码的字符串进行解码。对于UTF-8和UTF-16字符编码，我们使用了Charset.forName()方法来指定字符编码。

请注意，如果Base64编码的字符串本身不是使用UTF-8或UTF-16进行编码的，则在使用相应字符编码进行解码时会导致输出结果不正确。确保Base64编码的字符串和所使用的字符编码相匹配是非常重要的。