遍历二维数组中不完整的行时出现性能下降的原因是由于数组在内存中是连续存储的，而不完整的行会导致不连续的访问，从而增加了缓存未命中的次数，降低了性能。

解决办法是使用一维数组来代替二维数组，将二维数组展开成一维数组进行遍历。这样可以保证数据的连续访问，减少缓存未命中的次数，提升性能。

以下是一个示例代码，展示了如何使用一维数组来遍历二维数组：

public class Main {
    public static void main(String[] args) {
        int[][] matrix = {
                {1, 2, 3},
                {4, 5},
                {6, 7, 8, 9}
        };
        
        int rows = matrix.length; // 获取二维数组的行数
        int cols = 0; // 初始化列数为0
        
        // 遍历二维数组，找出最大的列数
        for (int i = 0; i < rows; i++) {
            cols = Math.max(cols, matrix[i].length);
        }
        
        // 将二维数组展开成一维数组
        int[] flattenedMatrix = new int[rows * cols];
        int index = 0;
        for (int i = 0; i < rows; i++) {
            for (int j = 0; j < matrix[i].length; j++) {
                flattenedMatrix[index++] = matrix[i][j];
            }
        }
        
        // 遍历展开后的一维数组
        for (int i = 0; i < flattenedMatrix.length; i++) {
            System.out.print(flattenedMatrix[i] + " ");
        }
    }
}

通过展开二维数组为一维数组，可以避免遍历不完整的行时出现的性能下降问题。