在编译Clojure为一个JAR文件后，如果正则表达式出现堆栈溢出错误，可以尝试以下解决方法：

1. 增加JVM堆栈大小：在项目的启动脚本或者命令行中增加JVM参数 -Xss，例如 -Xss4M，表示将堆栈大小设置为4MB。这可以通过增加堆栈的容量来解决堆栈溢出错误。

2. 优化正则表达式：有时候，正则表达式可能会因为复杂性而导致堆栈溢出错误。可以尝试简化、优化正则表达式的模式，以减少其复杂性。

3. 使用非递归的正则表达式：正则表达式默认使用递归匹配，这可能会导致堆栈溢出错误。可以尝试使用非递归的正则表达式，例如使用re-seq函数替代re-find函数。

以下是一个示例代码，展示如何使用非递归的正则表达式：

(require '[clojure.string :as str])

(defn find-all-matches [re s]
  (loop [matches []
         remaining s]
    (if-let [m (re-find re remaining)]
      (recur (conj matches m) (subs remaining (inc (.end m))))
      matches)))

(def regex #"abc")

(def input-str "abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc abc