在BigQuery中，可以使用UNNEST函数将数组展开为行，然后使用DISTINCT关键字来保留唯一值。以下是一个示例解决方法：

MERGE dataset.table1 t
USING (
  SELECT id, ARRAY(SELECT DISTINCT value FROM UNNEST(array1) UNION DISTINCT SELECT DISTINCT value FROM UNNEST(array2)) AS merged_array
  FROM dataset.table2
) s
ON t.id = s.id
WHEN MATCHED THEN
  UPDATE SET t.array = s.merged_array
WHEN NOT MATCHED THEN
  INSERT (id, array)
  VALUES (s.id, s.merged_array);

在上述示例中，我们使用UNNEST函数将array1和array2展开为多行，并使用DISTINCT关键字来保留唯一的值。然后，我们使用UNION DISTINCT运算符将两个展开的数组合并，并将结果存储在名为merged_array的新数组中。

接下来，我们使用MERGE语句将table2中的数据合并到table1中。如果匹配到相同的id，则执行UPDATE操作，将array字段更新为合并后的数组。如果没有匹配到id，则执行INSERT操作，将id和合并后的数组插入到table1中。

请注意，上述示例中的dataset和table1、table2是占位符，您需要根据实际情况替换为您的数据集和表名。