要比较不同大小的MongoDB数据库的性能，可以使用以下解决方法：

1. 创建测试数据：首先，创建几个不同大小的MongoDB数据库，可以使用随机数据生成器或者导入真实数据。确保每个数据库的大小差异明显。

2. 编写性能测试代码：使用适当的编程语言（如Python、Node.js等）编写性能测试代码。以下是一个使用Python的示例代码：

from pymongo import MongoClient
import time

# 连接MongoDB数据库
client = MongoClient('mongodb://localhost:27017/')
db = client['testdb']

# 测试查询性能
def test_query_performance():
    collection = db['testdata']
    start_time = time.time()
    # 执行查询操作
    result = collection.find({'field': 'value'})
    end_time = time.time()
    # 输出查询耗时
    print("Query time: ", end_time - start_time)

# 测试插入性能
def test_insert_performance():
    collection = db['testdata']
    start_time = time.time()
    # 执行插入操作
    for i in range(100000):
        collection.insert_one({'field': 'value'})
    end_time = time.time()
    # 输出插入耗时
    print("Insert time: ", end_time - start_time)

# 测试删除性能
def test_delete_performance():
    collection = db['testdata']
    start_time = time.time()
    # 执行删除操作
    collection.delete_many({'field': 'value'})
    end_time = time.time()
    # 输出删除耗时
    print("Delete time: ", end_time - start_time)

# 运行测试
test_query_performance()
test_insert_performance()
test_delete_performance()

3. 运行性能测试：运行性能测试代码，分别测试不同大小的MongoDB数据库的查询、插入和删除性能。记录每个操作的耗时。

4. 分析结果：比较不同大小数据库的性能测试结果。观察哪个大小的数据库在不同操作上的表现更好。

通过以上步骤，你可以比较不同大小的MongoDB数据库的性能。请注意，性能测试结果可能会受到硬件配置、网络环境和其他因素的影响，因此应该进行多次重复测试以获取准确的性能数据。