要比较两个Elasticsearch索引以找到缺失的文档，可以使用Elasticsearch的Scroll API和Python编程语言。以下是一个示例代码，用于比较两个名为“index1”和“index2”的索引，并找到在“index2”中存在但在“index1”中缺失的文档。

from elasticsearch import Elasticsearch

# 连接到Elasticsearch集群
es = Elasticsearch(['localhost:9200'])

# 定义要比较的两个索引名称
index1 = "index1"
index2 = "index2"

# 搜索index2中的所有文档
scroll = "2m"  # 滚动时间
body = {
  "query": {
    "match_all": {}
  }
}
results = es.search(index=index2, scroll=scroll, body=body)

# 初始化一个存储index2文档ID的集合
index2_docs = set()

# 检索index2中的文档ID并添加到集合中
for hit in results['hits']['hits']:
    index2_docs.add(hit['_id'])

# 使用scroll API继续检索剩余的文档
scroll_id = results['_scroll_id']
while True:
    results = es.scroll(scroll_id=scroll_id, scroll=scroll)
    if len(results['hits']['hits']) == 0:
        break
    for hit in results['hits']['hits']:
        index2_docs.add(hit['_id'])
    scroll_id = results['_scroll_id']

# 搜索index1中的所有文档
results = es.search(index=index1, scroll=scroll, body=body)

# 检查index1中的文档是否存在于index2中
missing_docs = []
for hit in results['hits']['hits']:
    if hit['_id'] not in index2_docs:
        missing_docs.append(hit['_id'])

# 打印缺失的文档ID
print("Missing documents in index1:")
for doc_id in missing_docs:
    print(doc_id)

请注意，这个示例代码假设你已经安装了Elasticsearch Python客户端库（elasticsearch），并且已经正确配置了Elasticsearch连接。你需要根据自己的实际情况修改主机和端口号。

这个代码使用了Elasticsearch的Scroll API来从索引中获取所有文档并保存在集合中。然后，它使用另一个索引的文档ID与集合进行比较，找到在一个索引中存在但在另一个索引中缺失的文档。最后，它打印出缺失的文档ID。