这里是一个使用Python的示例代码，可以比较两个文件并创建一个新文件来存储它们的差异：

def compare_files(file1, file2, output_file):
    with open(file1, 'r') as f1, open(file2, 'r') as f2, open(output_file, 'w') as output:
        lines1 = f1.readlines()
        lines2 = f2.readlines()

        diff = []
        for line in difflib.unified_diff(lines1, lines2, lineterm=''):
            diff.append(line)

        output.write('\n'.join(diff))

# 示例用法
file1 = 'file1.txt'
file2 = 'file2.txt'
output_file = 'diff.txt'

compare_files(file1, file2, output_file)

这段代码使用了Python的difflib模块来生成两个文件的差异。首先，它打开两个输入文件并读取它们的内容。然后，它使用difflib.unified_diff函数来比较两个文件的行，并将差异存储在一个列表中。最后，它将差异列表写入输出文件中。

请确保在运行代码之前安装了difflib模块（通常它是Python标准库的一部分）。