比较两个数据库中的表可以使用以下方法：

1. 使用SQL查询：通过编写SQL查询语句，将两个表中的数据进行比较。下面是一个示例，假设我们要比较的表是table1和table2，并且有一个共同的字段id。

SELECT *
FROM table1
WHERE id NOT IN (SELECT id FROM table2);

这个查询将返回在table1中存在，但在table2中不存在的记录。

2. 使用编程语言：使用编程语言如Python或Java连接两个数据库，并使用循环遍历每个表的记录进行比较。下面是一个使用Python的示例，假设我们使用的是MySQL数据库。

import pymysql

# 链接第一个数据库
conn1 = pymysql.connect(host='localhost', user='user1', password='password1', database='database1')
cursor1 = conn1.cursor()

# 链接第二个数据库
conn2 = pymysql.connect(host='localhost', user='user2', password='password2', database='database2')
cursor2 = conn2.cursor()

# 执行查询
sql = "SELECT * FROM table1"
cursor1.execute(sql)
table1_rows = cursor1.fetchall()

sql = "SELECT * FROM table2"
cursor2.execute(sql)
table2_rows = cursor2.fetchall()

# 比较记录
for row1 in table1_rows:
    if row1 not in table2_rows:
        print("Record not found in table2:", row1)

# 关闭连接
cursor1.close()
conn1.close()
cursor2.close()
conn2.close()

这个示例通过查询数据库获取表的记录，并使用循环遍历比较两个表中的记录。如果在table1中存在，但在table2中不存在，将打印出该记录。

以上是两种比较数据库表的方法，可以根据具体情况选择适合的方法。