在Mongoose中，如果您从一个文档中删除一个嵌入式文档，则默认情况下，该操作将自动持久化到数据库中。这意味着您可能没有机会检查要删除的文档是否满足某些条件。

为了避免这种情况，您可以将autopopulate: false选项添加到嵌套对象中：

const ParentSchema = new mongoose.Schema({
  embedded: {
    child: {
      type: mongoose.Schema.ObjectId,
      ref: 'Child',
      autopopulate: false  // 添加该选项
    }
  }
});

ParentSchema.plugin(require('mongoose-autopopulate'));

const ChildSchema = new mongoose.Schema({
  name: String
});

ChildSchema.plugin(require('mongoose-autopopulate'));

接下来，在要删除的文档上，使用.populate()方法手动填充嵌套属性。然后，您可以使用.populate()方法删除该文档，而不会自动持久化嵌套属性：

ParentModel.findById(parentId)
  .populate({
    path: 'embedded.child', 
    select: '_id'
  })
  .exec((err, doc) => {
    if (err) {
      // 处理错误
    } else {
      doc.embedded.child = null;
      doc.save((err) => {
        if (err) {
          // 处理错误
        } else {
          // 文档已成功更新
        }
      });
    }
  });

请注意，您需要使用.populate()方法加载嵌套属性，并选择只返回文档ID。然后，您可以将该属性设置为null或从嵌套属性数组中删除它，并使用.save()方法将文档保存回数据库中。