要解决“并非所有文件都能通过GitPython传输到Github”的问题，您可以尝试以下解决方法：

1. 使用Git的命令行界面：GitPython是一个Python库，封装了Git的命令行接口。但是，并非所有的Git命令都能通过GitPython完全支持。您可以尝试直接使用Git的命令行界面来处理无法通过GitPython传输的文件。

2. 使用GitPython的底层接口：GitPython提供了底层的Git对象，您可以使用这些对象来直接操作Git仓库。通过使用底层接口，您可以更灵活地处理无法通过GitPython传输的文件。下面是一个示例代码：

import git

repo = git.Repo('path/to/your/repo')

# 通过底层接口添加文件
index = repo.index
index.add(['file1.txt', 'file2.png'])

# 提交更改
index.commit('Added files')

# 推送到远程仓库
origin = repo.remote('origin')
origin.push()

3. 使用其他Git客户端库：如果GitPython无法满足您的需求，您可以尝试使用其他的Git客户端库，例如PyGit2或Dulwich。这些库提供了更多底层的Git操作接口，可能能够处理无法通过GitPython传输的文件。

请注意，无法通过GitPython传输到Github的文件可能有多种原因，例如文件大小超过限制、文件名包含特殊字符等。在尝试解决问题时，您需要根据具体的错误信息和情况进行调试和处理。