BioPython: KEGG REST一直报告HTTP错误403：禁止访问。
创始人
2024-12-19 01:01:46
0次
当使用BioPython的KEGG REST接口时，可能会遇到HTTP错误403：禁止访问的问题。这通常是因为KEGG对于公共用户的访问有一定的限制。以下是一种解决方法，可以通过添加用户代理来解决这个问题。
from Bio.KEGG.REST import kegg_get
# 添加用户代理
from urllib.request import urlopen
opener = urlopen
opener.addheaders = [('User-agent', 'Mozilla/5.0')]
# 使用添加了用户代理的opener来获取KEGG数据
kegg_get._opener = opener
# 通过KEGG REST获取数据
response = kegg_get('br:br08303')
# 打印结果
print(response.read())
在上面的代码中，我们使用urllib.request.urlopen创建了一个opener，并添加了一个用户代理。然后，我们将这个opener赋值给BioPython的KEGG REST接口的_opener属性，以便使用添加了用户代理的opener来获取数据。
这样，我们就可以在使用BioPython的KEGG REST接口时避免HTTP错误403：禁止访问的问题。请注意，这种方法仅适用于非商业用途，如果需要进行商业用途的访问，需要向KEGG申请相应的许可。
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