在BizTalk中，可以通过自定义C#代码来获取输入文件名。以下是一个示例解决方案：

1. 创建一个BizTalk项目，并在项目中添加一个接收文件的端口。
2. 在解决方案资源管理器中，右键单击项目，选择“添加”>“新建项”>“类”来添加一个新的类文件。
3. 在新的类文件中，编写以下代码：

using Microsoft.BizTalk.Component.Interop;
using Microsoft.BizTalk.Message.Interop;
using System.Data.SqlClient;

namespace BizTalkProject
{
    public class CustomPipelineComponent : IComponent
    {
        public IBaseMessage Execute(IPipelineContext pContext, IBaseMessage pInMsg)
        {
            // 获取输入文件名
            string fileName = (string)pInMsg.Context.Read("ReceivedFileName", "http://schemas.microsoft.com/BizTalk/2003/file-properties");

            // 使用文件名进行SQL查询
            string connectionString = "Data Source=ServerName;Initial Catalog=DatabaseName;Integrated Security=True";
            string query = "SELECT * FROM TableName WHERE FileName = @FileName";

            using (SqlConnection connection = new SqlConnection(connectionString))
            {
                using (SqlCommand command = new SqlCommand(query, connection))
                {
                    command.Parameters.AddWithValue("@FileName", fileName);

                    connection.Open();
                    // 执行查询操作
                    SqlDataReader reader = command.ExecuteReader();
                    // 处理查询结果
                    while (reader.Read())
                    {
                        // 处理查询结果
                    }
                    reader.Close();
                }
            }

            return pInMsg;
        }

        // 实现其他IComponent接口的成员
        // ...
    }
}

4. 在BizTalk项目中创建一个自定义管道，然后在该管道的解码器阶段添加一个自定义组件。将自定义组件配置为上面创建的CustomPipelineComponent类。
5. 在接收文件的端口上，将管道设置为刚刚创建的自定义管道。

通过这个解决方案，当BizTalk接收到文件时，它将使用自定义管道对文件进行处理，并在处理过程中获取输入文件名，并使用该文件名进行SQL查询。