要在不使用Java.io.File的情况下使用Checkstyle API，您可以使用checkstyle的AST（抽象语法树）来检查和处理Java代码。以下是一个解决方法的示例代码：

import com.puppycrawl.tools.checkstyle.*;
import com.puppycrawl.tools.checkstyle.api.*;

public class CheckstyleASTExample {

    public static void main(String[] args) throws Exception {
        // 创建一个DefaultConfiguration实例，用于配置Checkstyle的规则
        DefaultConfiguration checkstyleConfig = new DefaultConfiguration("checkstyle");

        // 添加要使用的Checkstyle规则
        checkstyleConfig.addChild(createCheckerConfig("com.puppycrawl.tools.checkstyle.checks.coding.MagicNumberCheck"));

        // 创建一个Checkstyle的上下文
        Context checkstyleContext = new Context();

        // 使用自定义的Checkstyle文件加载器加载规则配置
        ConfigurationLoader configurationLoader = ConfigurationLoader.getInstance();
        Configuration checkstyleConfiguration = configurationLoader.loadConfiguration(checkstyleConfig, checkstyleContext);

        // 创建一个Checkstyle的Checker实例
        Checker checker = new Checker();
        checker.setModuleClassLoader(Checker.class.getClassLoader());
        checker.configure(checkstyleConfiguration);

        // 要检查的Java代码
        String javaCode = "public class Example { private int magicNumber = 42; }";

        // 将Java代码解析为抽象语法树（AST）
        DetailAST ast = checker.parse(javaCode);

        // 检查抽象语法树
        checker.process(ast);

        // 获取检查结果
        FileContents fileContents = new FileContents(javaCode);
        FileSet fileSet = new FileSet();
        fileSet.addFileContents(fileContents);
        checker.process(fileSet);

        // 获取所有的检查错误
        CheckstyleResults results = checker.getResults();
        for (String error : results.getMessages()) {
            System.out.println(error);
        }
    }

    // 创建一个Checkstyle规则的配置
    private static DefaultConfiguration createCheckerConfig(String checkName) {
        DefaultConfiguration config = new DefaultConfiguration(checkName);
        return config;
    }
}

上述代码示例中使用了Checkstyle的API来解析和检查Java代码。首先，我们使用checkstyle的DefaultConfiguration来配置要使用的Checkstyle规则。然后，我们创建一个Checkstyle的上下文，并使用自定义的ConfigurationLoader来加载规则配置。接下来，我们创建一个Checkstyle的Checker实例，并使用configure方法来配置Checker实例。然后，我们将要检查的Java代码解析为抽象语法树（AST），并使用Checker的process方法来检查抽象语法树。最后，我们通过Checker的getResults方法获取检查结果，并打印出所有的检查错误。

请注意，这只是一个简单的示例，您可以根据自己的需求来配置和使用Checkstyle的API。