要解决Apache虚拟主机目录从未被使用的问题，您可以按照以下步骤进行操作：

1. 确保虚拟主机配置文件存在于Apache的配置目录中（通常是/etc/httpd/conf.d/或/etc/apache2/sites-available/）。

2. 打开虚拟主机配置文件，并确保以下内容已正确配置：

    ServerName yourdomain.com
    DocumentRoot /path/to/your/document/root
    
        Options FollowSymLinks
        AllowOverride All
        Require all granted
    
    ErrorLog /var/log/apache2/error.log
    CustomLog /var/log/apache2/access.log combined

确保将yourdomain.com替换为您要使用的域名，并将/path/to/your/document/root替换为实际的文档根目录路径。

3. 保存并关闭虚拟主机配置文件。

4. 重新启动Apache服务器以使更改生效：

sudo service apache2 restart

或者是

sudo systemctl restart httpd

5. 确保您的域名正确地解析到服务器的IP地址。您可以通过运行以下命令来验证：

ping yourdomain.com

如果IP地址与您的服务器IP地址匹配，则表示解析正确。

6. 在浏览器中输入您的域名来查看是否正常访问虚拟主机目录。如果看到您的网站或者文件列表，则表示虚拟主机目录已成功使用。

通过按照上述步骤配置和验证，您可以解决Apache虚拟主机目录从未被使用的问题。