在ASP.NET Core应用程序中，App Insights的Instrumentation Key通常是从配置文件中读取的。可以使用appsettings.json或appsettings.{Environment}.json文件来存储应用程序的配置信息，包括Instrumentation Key。

以下是一个示例的appsettings.json文件：

{
  "AppInsights": {
    "InstrumentationKey": "YOUR_INSTRUMENTATION_KEY"
  }
}

然后，在Startup.cs文件的ConfigureServices方法中，可以使用Configuration对象来读取配置文件中的值，并将其传递给App Insights的服务：

using Microsoft.ApplicationInsights.Extensibility;

public class Startup
{
    public Startup(IConfiguration configuration)
    {
        Configuration = configuration;
    }

    public IConfiguration Configuration { get; }

    public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
    {
        // 从配置文件中读取Instrumentation Key
        var instrumentationKey = Configuration["AppInsights:InstrumentationKey"];

        // 注册App Insights服务
        services.AddApplicationInsightsTelemetry(instrumentationKey);

        // 其他服务的注册和配置...
    }
}

通过以上代码，应用程序将从配置文件中读取Instrumentation Key，并将其传递给App Insights的服务。这样，App Insights将使用正确的Instrumentation Key来跟踪应用程序的日志和指标。