要使用setThemingColor方法设置颜色覆盖导出PDF，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 首先，确保你已经安装了所需的库。在这种情况下，你需要安装使用APS（ActivePDF Server）的库。

2. 在代码中，创建一个APS对象并打开要转换为PDF的文档。例如：

APS.ServerInstance server = new APS.ServerInstance();
server.OpenDocument("input.docx", "");

3. 接下来，使用setThemingColor方法设置颜色覆盖。该方法接受两个参数：要替换的颜色和替换后的颜色。例如，将红色替换为蓝色：

server.setThemingColor("red", "blue");

4. 最后，使用ExportToPDF方法将文档导出为PDF。例如：

server.ExportToPDF("output.pdf");

完整的示例代码如下所示：

using APS;

class Program
{
    static void Main(string[] args)
    {
        // 创建APS对象并打开文档
        ServerInstance server = new ServerInstance();
        server.OpenDocument("input.docx", "");

        // 设置颜色覆盖
        server.setThemingColor("red", "blue");

        // 导出为PDF
        server.ExportToPDF("output.pdf");
    }
}

请注意，这只是一个示例代码，你需要根据自己的实际情况进行调整。另外，你可能需要根据你使用的编程语言和特定库的要求进行一些额外的设置和配置。