要解决ASP.NET Core 3.1中自定义身份验证处理程序授权失败的问题，可以按照以下步骤进行处理：

1. 首先，确保你的应用程序已经设置了身份验证和授权。在Startup.cs文件的ConfigureServices方法中添加以下代码：

services.AddAuthentication("CustomScheme")
    .AddScheme("CustomScheme", options => { });

2. 创建一个自定义的身份验证处理程序CustomAuthenticationHandler，继承自AuthenticationHandler类，并实现其抽象方法。在CustomAuthenticationHandler中，你可以定义对请求进行身份验证的逻辑，并在验证成功或失败时返回相应的结果。以下是一个简单的示例：

public class CustomAuthenticationHandler : AuthenticationHandler
{
    public CustomAuthenticationHandler(IOptionsMonitor options, ILoggerFactory logger, UrlEncoder encoder, ISystemClock clock)
        : base(options, logger, encoder, clock)
    {
    }

    protected override async Task HandleAuthenticateAsync()
    {
        // 在此处编写自定义的身份验证逻辑
        // 如果验证成功，可以使用以下代码创建一个ClaimsIdentity对象，并通过调用Success方法返回身份验证结果
        var identity = new ClaimsIdentity("CustomScheme");
        var principal = new ClaimsPrincipal(identity);
        var ticket = new AuthenticationTicket(principal, "CustomScheme");
        return AuthenticateResult.Success(ticket);

        // 如果验证失败，可以使用以下代码返回身份验证失败的结果
        // return AuthenticateResult.Fail("Authentication failed.");
    }
}

3. 创建一个CustomAuthenticationOptions类，用于设置自定义身份验证处理程序的选项。你可以在该类中添加任何自定义的配置选项。以下是一个示例：

public class CustomAuthenticationOptions : AuthenticationSchemeOptions
{
    public string CustomOption { get; set; }
}

4. 确保在Configure方法中使用Authentication中间件，并添加授权策略。在Startup.cs文件的Configure方法中添加以下代码：

app.UseAuthentication();
app.UseAuthorization();

5. 在需要进行授权的地方使用[Authorize]属性来保护你的资源。例如，在Controller的Action方法中使用[Authorize]属性：

[Authorize]
public IActionResult MyProtectedAction()
{
    // 执行需要授权的操作
    return View();
}

通过以上步骤，你可以实现自定义身份验证处理程序，并进行授权。如果身份验证失败，将返回401 Unauthorized。