要解决ASP.NET Core 3与Autofac忽略了IIS设置，并且日志显示"正在侦听: http://localhost:5000"的问题，您可以尝试以下解决方法：

1. 确保你的应用程序配置正确，并且可以在IIS中正常运行。确保你的IIS站点的绑定设置正确，并且端口与应用程序中的端口一致。

2. 检查你的应用程序的Program.cs文件，确保正确设置了WebHostBuilder。确保使用了UseIIS和UseIISIntegration方法，并将UseUrls方法设置为IIS站点的URL。

   示例代码：

   public static IWebHostBuilder CreateWebHostBuilder(string[] args) =>
       WebHost.CreateDefaultBuilder(args)
           .UseIIS()
           .UseIISIntegration()
           .UseUrls("http://localhost:5000")
           .UseStartup();
   

3. 确保你的Autofac配置正确，并且已经注册了所需的服务。确保在ConfigureServices方法中调用了Autofac的Populate方法，并且在ConfigureContainer方法中配置了Autofac容器。

   示例代码：

   public IServiceProvider ConfigureServices(IServiceCollection services)
   {
       services.AddMvc().SetCompatibilityVersion(CompatibilityVersion.Version_3_0);
       
       var builder = new ContainerBuilder();
       builder.Populate(services);
       builder.RegisterType().As();
       // 添加其他服务的注册
   
       var container = builder.Build();
   
       return new AutofacServiceProvider(container);
   }
   

4. 如果你使用的是Kestrel作为Web服务器，确保你的应用程序的launchSettings.json文件中的"applicationUrl"设置与IIS站点的URL一致。

   示例代码：

   "profiles": {
     "IIS Express": {
       "commandName": "IISExpress",
       "launchBrowser": true,
       "launchUrl": "api/values",
       "applicationUrl": "http://localhost:5000"
     }
   }
   

5. 重启你的应用程序并重新发布到IIS。确保应用程序的发布路径正确，并且已经将应用程序部署到IIS站点。

如果以上方法都没有解决问题，你可能需要进一步检查日志和调试信息，以确定问题的根本原因。