在ASP.NET Core中，使用Cookie身份验证和JWT身份验证是非常常见的。如果它们在您的应用程序中不正常工作，可能是由于配置或代码错误导致的。下面是一些可能的解决方法：

1. 检查配置：首先确保您的应用程序正确配置了Cookie身份验证和JWT身份验证。在Startup.cs文件中，您需要添加相应的中间件和配置。例如，对于Cookie身份验证，您需要使用AddAuthentication()和AddCookie()方法进行配置。对于JWT身份验证，您需要使用AddAuthentication()和AddJwtBearer()方法进行配置。

// Cookie身份验证配置示例
services.AddAuthentication(CookieAuthenticationDefaults.AuthenticationScheme)
    .AddCookie(options =>
    {
        options.Cookie.Name = "YourCookieName";
        options.LoginPath = "/Account/Login";
    });

// JWT身份验证配置示例
services.AddAuthentication(JwtBearerDefaults.AuthenticationScheme)
    .AddJwtBearer(options =>
    {
        options.TokenValidationParameters = new TokenValidationParameters
        {
            ValidateIssuer = true,
            ValidateAudience = true,
            ValidateLifetime = true,
            ValidateIssuerSigningKey = true,
            ValidIssuer = "YourIssuer",
            ValidAudience = "YourAudience",
            IssuerSigningKey = new SymmetricSecurityKey(Encoding.UTF8.GetBytes("YourSigningKey"))
        };
    });

确保您使用了正确的配置，并且在正确的地方调用了AddAuthentication()方法。

2. 检查授权属性：在需要进行身份验证和授权的控制器或操作方法上，确保您使用了正确的[Authorize]属性。对于Cookie身份验证，使用[Authorize]即可。对于JWT身份验证，使用[Authorize(AuthenticationSchemes = JwtBearerDefaults.AuthenticationScheme)]。

// Cookie身份验证示例
[Authorize]

// JWT身份验证示例
[Authorize(AuthenticationSchemes = JwtBearerDefaults.AuthenticationScheme)]

确保您在正确的位置使用了适当的授权属性。

3. 检查登录和认证代码：如果您的身份验证不正常工作，可能是由于登录或认证代码中的错误导致的。确保您在登录时使用了正确的方法，并且在认证过程中没有出现问题。例如，对于Cookie身份验证，您需要在登录成功后调用SignInAsync()方法来设置身份验证Cookie。对于JWT身份验证，您需要在认证成功后生成并返回JWT令牌。

// Cookie身份验证示例
var claims = new List
{
    new Claim(ClaimTypes.Name, "YourUserName")
};

var claimsIdentity = new ClaimsIdentity(claims, CookieAuthenticationDefaults.AuthenticationScheme);
var authProperties = new AuthenticationProperties
{
    ExpiresUtc = DateTime.UtcNow.AddMinutes(30),
    IsPersistent = true
};

await HttpContext.SignInAsync(CookieAuthenticationDefaults.AuthenticationScheme, new ClaimsPrincipal(claimsIdentity), authProperties);

// JWT身份验证示例
var tokenHandler = new JwtSecurityTokenHandler();
var key = Encoding.UTF8.GetBytes("YourSigningKey");
var tokenDescriptor = new SecurityTokenDescriptor
{
    Subject = new ClaimsIdentity(new Claim[]
    {
        new Claim(ClaimTypes.Name, "YourUserName")
    }),
    Expires = DateTime.UtcNow.AddDays(7),
    SigningCredentials = new SigningCredentials(new SymmetricSecurityKey(key), SecurityAlgorithms.HmacSha256Signature)
};

var token = tokenHandler.CreateToken(tokenDescriptor);
var tokenString = tokenHandler.WriteToken(token);

return tokenString;

确保您在登录和认证代码中使用了正确的方法，并在正确的地方调用了这些方法。

这些是解决ASP.NET Core中Cookie身份验证和JWT身份验证不正常工作的一些常见方法。根据您的具体情况，可能还需要进一步的调试和排查问题。