在使用AutoMapper时，确实无法直接更新集合中的项目。但是，可以通过以下几种方式来解决这个问题：

1. 使用循环遍历集合，并逐个映射和更新项目。

foreach (var sourceItem in sourceList)
{
    var destinationItem = destinationList.FirstOrDefault(d => d.Id == sourceItem.Id);
    if (destinationItem != null)
    {
        // 使用AutoMapper映射属性
        Mapper.Map(sourceItem, destinationItem);
        // 更新其他属性
        destinationItem.OtherProperty = sourceItem.OtherProperty;
    }
    else
    {
        // 如果目标集合中不存在对应的项目，则将源项目映射为目标项目并添加到目标集合中
        destinationItem = Mapper.Map(sourceItem);
        destinationList.Add(destinationItem);
    }
}

2. 使用自定义映射配置来处理集合映射。

Mapper.Initialize(cfg =>
{
    cfg.CreateMap()
        .ForMember(dest => dest.Id, opt => opt.Ignore()) // 忽略Id属性，以便手动处理
        // 其他映射配置
        // ...
        ;
});

foreach (var sourceItem in sourceList)
{
    var destinationItem = destinationList.FirstOrDefault(d => d.Id == sourceItem.Id);
    if (destinationItem != null)
    {
        // 使用AutoMapper映射属性
        Mapper.Map(sourceItem, destinationItem);
        // 更新其他属性
        destinationItem.OtherProperty = sourceItem.OtherProperty;
    }
    else
    {
        // 如果目标集合中不存在对应的项目，则将源项目映射为目标项目并添加到目标集合中
        destinationItem = Mapper.Map(sourceItem);
        destinationList.Add(destinationItem);
    }
}

3. 使用手动映射来更新集合中的项目。

foreach (var sourceItem in sourceList)
{
    var destinationItem = destinationList.FirstOrDefault(d => d.Id == sourceItem.Id);
    if (destinationItem != null)
    {
        // 手动映射属性
        destinationItem.Property1 = sourceItem.Property1;
        destinationItem.Property2 = sourceItem.Property2;
        // 更新其他属性
        destinationItem.OtherProperty = sourceItem.OtherProperty;
    }
    else
    {
        // 如果目标集合中不存在对应的项目，则将源项目映射为目标项目并添加到目标集合中
        destinationItem = new DestinationItem
        {
            Id = sourceItem.Id,
            Property1 = sourceItem.Property1,
            Property2 = sourceItem.Property2,
            // 其他属性
            OtherProperty = sourceItem.OtherProperty
        };
        destinationList.Add(destinationItem);
    }
}

以上是几种解决方法的示例代码，具体的实现方式可以根据实际需求和项目结构进行调整。