AutoMapper是一个用于对象映射的开源库，可以简化对象之间的转换。在多对多映射中，包含关联表数据时，我们可以使用AutoMapper的ForMember方法来配置映射。

以下是一个使用AutoMapper进行多对多映射的代码示例：

1. 首先，我们需要定义两个实体类，分别是源实体类和目标实体类，以及它们之间的关联实体类。

public class SourceEntity
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
    public ICollection Destinations { get; set; }
}

public class DestinationEntity
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
    public ICollection Sources { get; set; }
}

public class SourceDestinationAssociation
{
    public int SourceEntityId { get; set; }
    public int DestinationEntityId { get; set; }
}

public class DestinationSourceAssociation
{
    public int DestinationEntityId { get; set; }
    public int SourceEntityId { get; set; }
}

2. 接下来，我们需要创建映射配置类，其中定义了源实体类到目标实体类的映射关系。

public class MappingProfile : Profile
{
    public MappingProfile()
    {
        CreateMap()
            .ForMember(dest => dest.Id, opt => opt.MapFrom(src => src.Id))
            .ForMember(dest => dest.Name, opt => opt.MapFrom(src => src.Name))
            .ForMember(dest => dest.Sources, opt => opt.MapFrom(src => src.Destinations.Select(d => new DestinationSourceAssociation { DestinationEntityId = d.DestinationEntityId, SourceEntityId = src.Id })));

        CreateMap()
            .ForMember(dest => dest.Id, opt => opt.MapFrom(src => src.Id))
            .ForMember(dest => dest.Name, opt => opt.MapFrom(src => src.Name))
            .ForMember(dest => dest.Destinations, opt => opt.MapFrom(src => src.Sources.Select(s => new SourceDestinationAssociation { SourceEntityId = s.SourceEntityId, DestinationEntityId = src.Id })));
    }
}

3. 在使用映射之前，需要先初始化AutoMapper，并注册映射配置类。

Mapper.Initialize(cfg => cfg.AddProfile());

4. 最后，我们可以使用AutoMapper进行多对多映射。

var sourceEntity = new SourceEntity
{
    Id = 1,
    Name = "Source Entity",
    Destinations = new List
    {
        new SourceDestinationAssociation { DestinationEntityId = 1 },
        new SourceDestinationAssociation { DestinationEntityId = 2 }
    }
};

var destinationEntity = Mapper.Map(sourceEntity);

在上面的示例中，我们通过映射配置类将源实体类SourceEntity映射到目标实体类DestinationEntity，并且包含了关联表数据。在映射配置中，我们使用ForMember方法来指定每个属性的映射关系，包括多对多关联关系的映射。