解决这个问题的方法主要有两种：

1. 配置AutoMapper映射规则 对于Automapper生成的奇怪的SQL查询，可能是因为AutoMapper的映射规则配置不正确导致的。可以检查一下映射规则是否正确，包括字段名、字段类型等。确保源对象和目标对象的属性能够正确地映射。

示例代码：

// 创建映射规则
var config = new MapperConfiguration(cfg =>
{
    cfg.CreateMap()
        .ForMember(dest => dest.DestinationProperty, opt => opt.MapFrom(src => src.SourceProperty));
});

// 创建Mapper对象
var mapper = config.CreateMapper();

// 使用Mapper对象进行映射
var destinationObj = mapper.Map(sourceObj);

2. 使用显式映射选项 如果AutoMapper的默认映射规则无法满足需求，可以使用显式映射选项来定义自定义映射规则。通过使用ForMember方法，可以指定源对象和目标对象之间属性的映射关系。

示例代码：

// 创建映射规则
var config = new MapperConfiguration(cfg =>
{
    cfg.CreateMap()
        .ForMember(dest => dest.DestinationProperty, opt => opt.MapFrom(src => src.SourceProperty));
});

// 创建Mapper对象
var mapper = config.CreateMapper();

// 使用Mapper对象进行映射
var destinationObj = mapper.Map(sourceObj);

以上两种方法可以帮助解决Automapper生成奇怪SQL查询的问题。如果问题仍然存在，建议检查一下源对象和目标对象的定义，以及数据库表结构是否正确。