使用批量更新操作的同时，将集合中的数据分成多个块进行更新处理。可以使用以下代码来分块更新DocumentDB集合：

import boto3
from pymongo import MongoClient

# 创建DocumentDB客户端
client = boto3.client('docdb')

# 连接集合
client = MongoClient('mongodb://:@:/?ssl=true&replicaSet=&readpreference=secondaryPreferred')
db = client.mydatabase
collection = db.mycollection

# 分块更新操作
bulk = collection.initialize_unordered_bulk_op()
bulk_size = 1000 # 每个块的大小
i = 0
for doc in collection.find():
    bulk.find({'_id': doc['_id']}).update({'$set': {'new_field': 'new_value'}})
    i += 1
    if i % bulk_size == 0:
        bulk.execute()
        bulk = collection.initialize_unordered_bulk_op()

if i % bulk_size != 0:
    bulk.execute()

上述代码将集合中的数据每1000个为一块进行更新操作，可以有效地减少长时间运行的问题。