使用Apache Beam可以将两个不等行数的集合进行连接，可以通过以下代码示例实现：

import apache_beam as beam
from apache_beam import Create, ParDo, GroupByKey, CombineValues

# 创建两个不等行数的集合
collection1 = [
    ('key1', 'value1'),
    ('key2', 'value2'),
    ('key3', 'value3')
]

collection2 = [
    ('key1', 'value4'),
    ('key2', 'value5'),
    ('key4', 'value6')
]

# 定义连接函数
def join_collections(element):
    # 获取键和值
    key, values = element
    values1, values2 = values

    # 进行连接操作
    for value1 in values1:
        for value2 in values2:
            yield (key, (value1, value2))

# 创建Pipeline
with beam.Pipeline() as pipeline:
    # 通过Create将两个集合作为PCollection输入
    input1 = pipeline | 'Create input1' >> Create(collection1)
    input2 = pipeline | 'Create input2' >> Create(collection2)

    # 将两个PCollection合并为一个键值对的PCollection
    merged = ((input1, input2)
              | 'Merge inputs' >> beam.Flatten()
              | 'Group by key' >> GroupByKey()
              | 'Combine values' >> CombineValues(join_collections))

    # 打印连接结果
    merged | 'Print output' >> beam.Map(print)

上述代码示例中，首先创建了两个不等行数的集合collection1和collection2。然后定义了join_collections函数用于将两个集合进行连接，它接收一个键值对作为输入，并将两个集合中的元素进行连接操作。

在Pipeline中，使用Create将两个集合作为PCollection输入，然后使用Flatten将它们合并为一个PCollection。接下来使用GroupByKey将相同键的元素分组在一起，然后使用CombineValues将每个键的两个集合调用join_collections函数进行连接操作。

最后，通过Map将连接结果打印出来。