解决这个问题的方法是使用深拷贝（deep copy）来保存子对象，而不是直接复制父对象。深拷贝会递归地复制所有子对象，确保每个对象都是独立的，而不是共享引用。

下面是一个示例代码，展示了使用深拷贝保存子对象的方法：

import copy

class SubObject:
    def __init__(self, value):
        self.value = value

class ParentObject:
    def __init__(self, sub_object):
        self.sub_object = sub_object

sub_object = SubObject(10)
parent_object = ParentObject(sub_object)

# 使用深拷贝保存子对象
copied_parent_object = copy.deepcopy(parent_object)

# 修改子对象的值
sub_object.value = 20

# 输出父对象和复制后的父对象的子对象的值
print(parent_object.sub_object.value)  # 输出 20
print(copied_parent_object.sub_object.value)  # 输出 10

在上面的代码中，我们使用copy.deepcopy()函数来进行深拷贝，它会递归地复制整个对象图。这样，子对象会被独立保存，父对象和复制后的父对象的子对象不再共享引用。

注意，深拷贝可能会导致性能上的开销，因为它需要递归地复制整个对象图。在实际应用中，需要权衡使用深拷贝的必要性和性能要求。