要编写Angular 6指令的单元测试，可以按照以下步骤进行：

1. 创建一个新的Angular 6项目。

2. 在项目中创建一个指令。例如，创建一个名为CustomDirective的指令。

import { Directive, ElementRef } from '@angular/core';

@Directive({
  selector: '[appCustomDirective]'
})
export class CustomDirective {
  constructor(private elementRef: ElementRef) {
    this.elementRef.nativeElement.style.backgroundColor = 'red';
  }
}

3. 在项目中创建一个新的单元测试文件。例如，创建一个名为custom.directive.spec.ts的文件。

import { TestBed, ComponentFixture } from '@angular/core/testing';
import { Component, DebugElement } from '@angular/core';
import { By } from '@angular/platform-browser';
import { CustomDirective } from './custom.directive';

@Component({
  template: `
    

  `
})
class TestComponent {}

describe('CustomDirective', () => {
  let component: TestComponent;
  let fixture: ComponentFixture;
  let element: DebugElement;

  beforeEach(() => {
    TestBed.configureTestingModule({
      declarations: [CustomDirective, TestComponent]
    });

    fixture = TestBed.createComponent(TestComponent);
    component = fixture.componentInstance;
    element = fixture.debugElement.query(By.directive(CustomDirective));
  });

  it('should apply red background color to the element', () => {
    fixture.detectChanges();
    expect(element.nativeElement.style.backgroundColor).toBe('red');
  });
});

在上述代码中，我们创建了一个TestComponent，并在其中使用了CustomDirective。然后，我们创建了一个TestBed实例，并在其中配置了CustomDirective和TestComponent。然后，我们创建了TestComponent的实例，并查询到使用了CustomDirective的元素。最后，我们执行了一个断言来验证其背景颜色是否为红色。

4. 运行单元测试。在命令行中执行ng test命令来运行单元测试。