使用Apache Beam的Beam SQL扩展来解决这个问题。

Beam SQL是一个用于在Apache Beam中执行SQL查询和转换的扩展。它可以让开发人员使用标准的SQL查询语言，在Apache Beam和BigQuery之间轻松切换。使用Beam SQL，可以将SQL查询和转换应用于数据管道的任何阶段，而不仅限于BigQueryIO.write()阶段。

通过Beam SQL，可以使用SQL函数来处理数据，包括聚合、字符串操作、日期操作等。例如，以下代码演示如何使用Beam SQL中的日期函数来计算数据中的日期差异：

import apache_beam as beam
from apache_beam.runners.interactive import interactive_runner
from apache_beam.runners.direct.direct_runner import DirectRunner
from apache_beam.io.gcp.bigquery import BigQueryDisposition
from apache_beam.io.gcp.bigquery import WriteDisposition
from apache_beam.transforms.sql import SqlTransform

# 查询数据
query = """
    SELECT 
        date1, 
        date2, 
        DATEDIFF(date1, date2) AS day_difference
    FROM 
        `my-project.my-dataset.my-table`
"""

# 定义管道并运行
with beam.Pipeline(runner=DirectRunner()) as pipeline:
    rows = (
        pipeline 
        | SqlTransform(query)
        | 'Write to BigQuery' >> beam.io.WriteToBigQuery(
            'output_table',
            write_disposition=WriteDisposition.WRITE_APPEND,
            create_disposition=beam.io.BigQueryDisposition.CREATE_IF_NEEDED
        )
    )

# 执行管道
result = pipeline.run()

上述代码中，我们使用SqlTransform将查询应用于数据管道，然后将结果写入BigQuery中的输出表。在查询中，我们使用了BigQuery内置的日期差异函数DATEDIFF来计算date1和date2之间的日期差异。

Beam SQL扩展提供了一种容易理解和使用的选项，以使用SQL功能在Apache Beam中执行查询和转