下面是一个使用Python的代码示例，比较两个CSV文件的内容，并根据第三个文件中的指定关系进行操作：

import csv

def compare_csv_files(file1, file2, relation_file):
    # 读取第一个CSV文件
    with open(file1, 'r') as f1:
        reader1 = csv.reader(f1)
        data1 = list(reader1)
    
    # 读取第二个CSV文件
    with open(file2, 'r') as f2:
        reader2 = csv.reader(f2)
        data2 = list(reader2)
    
    # 读取关系文件
    with open(relation_file, 'r') as rf:
        reader_relation = csv.reader(rf)
        relations = list(reader_relation)
    
    # 比较两个CSV文件的内容
    for relation in relations:
        id1 = relation[0]
        id2 = relation[1]
        
        # 根据关系文件中的指定关系进行操作
        if id1 in data1 and id2 in data2:
            # TODO: 执行相关操作
            print(f"{id1} 和 {id2} 存在指定关系")
        else:
            # TODO: 执行其他操作
            print(f"{id1} 和 {id2} 不存在指定关系")

# 使用示例
file1 = 'file1.csv'
file2 = 'file2.csv'
relation_file = 'relation.csv'
compare_csv_files(file1, file2, relation_file)

在这个示例中，我们首先使用csv.reader函数从CSV文件中读取数据，并将其存储在列表中。然后，我们使用list函数将读取的数据转换为列表形式。

然后，我们使用open函数打开关系文件，并使用csv.reader函数读取关系文件中的数据，并将其存储在列表中。

接下来，我们使用一个循环遍历关系列表中的每个关系。对于每个关系，我们提取出id1和id2，并检查它们是否在两个数据列表中。然后，根据关系文件中的指定关系进行相应的操作。

请注意，示例中的TODO部分需要根据实际需求进行相应的操作。你可以根据实际情况来执行所需的操作，例如比较、合并、筛选等。

希望这个示例能够帮助到你！