比较两个CSV文件并输出具有相同基因名称的列。
创始人
2024-12-14 00:31:22
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- 导入所需的Python库：pandas和numpy。
- 使用pandas读入两个CSV文件，并将它们存储为dataframe。
- 使用numpy.intersect1d函数获取两个DataFrames中的基因名称的交集。将这些基因名称存储在一个列表中。
- 对于每个DataFrame，删除不在交集列表中的所有列。
- 将两个DataFrames合并并输出结果。
代码示例：
import pandas as pd
import numpy as np
# 读入CSV文件并将其存储为DataFrames
df1 = pd.read_csv("file1.csv")
df2 = pd.read_csv("file2.csv")
# 从DataFrames中获取基因列表的交集
intersect_genes = np.intersect1d(df1.columns, df2.columns)
# 只保留具有交集基因名称的列
df1 = df1[intersect_genes]
df2 = df2[intersect_genes]
# 合并两个DataFrames并输出结果
result = pd.concat([df1, df2], axis=1)
print(result)
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